Аукцион проводился по 5 лотам: 

• вакцина против краснухи;
• вакцина против коклюша, дифтерии, столбняка и вирусного гепатита В;
• вакцина для профилактики вирусного гепатита В (детская доза);
• вакцина для профилактики вирусного гепатита В (взрослая доза) - 2 лота.

В аукционе по каждому лоту участовали от 2 до 5 компаний, победителем становилась компания, предложившая наиболее низкую цену.

В общей сложности по 5 лотам была достигнута экономия в среднем 50% от начальной цены контракта.

По решению Правительства Российской Федерации и Минздравсоцразвития России сэкономленные средства могут быть направлены на закупки большего количества вакцин с целью расширения возрастных групп лиц, планируемых к вакцинации, или использованы на другие статьи в рамках приоритетного национального проекта в сфере здравоохранения в 2007 году.

Столь значительная экономия средств стала возможна благодаря тому, что с 2006 года закупки лекарственных средств в рамках национального приоритетного проекта в сфере здравоохранения стали осуществляться способом проведения аукционов, где государственный контракт заключается с поставщиком, предложившим наименьшую цену. До 2006 года закупки вакцин, включенных в Национальный календарь профилактических прививок, проводились на основании постановления Правительства Российской Федерации от 26 сентября 1997 г. № 1222 «О продукции, закупаемой для государственных нужд без проведения торгов (конкурсов)».

Вместе с тем, руководство Росздрава выражает обеспокоенность возможным снижением качества вакцин и выражает надежду на тесное сотрудничество с Федеральной службой по контролю в сфере здравоохранения и социального развития и Федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека в целях контроля за качеством вакцин, поставляемых в субъекты Российской Федерации в рамках национального приоритетного проекта в сфере здравоохранения.