К примеру, несвоевременное исполнение плана подготовки актов по реализации приоритетных национальных проектов в 2007 г. существенно затормозило строительство медицинских центров высоких медицинских технологий, централизованных закупок оборудования и расходных материалов, диагностического оборудования для организации первичной медико-санитарной помощи. В связи с тем, что не были поставлены в некоторые регионы своевременно вакцины, пришлось отодвинуть сроки проведения вакцинации детей.

Анализ, проведенный экспертами Счетной палаты, показал, что при разработке показателей эффективности использования ассигнований на реализацию задач Минздравсоцразвития России по обеспечению доступности и качества медицинской помощи, а также предупреждению болезней темпы изменения показателей установлены таким образом, что для достижения некоторых целевых значений потребуется более 50 лет. По мнению Сергея Колесникова, необходима разработка более конкретных индикаторных показателей выполнения задач проекта "Здоровье".

Председатель Комитета Госдумы по охране здоровья Ольга Борзова поддержала выводы Счетной палаты о необходимости создания единой системы мониторинга использования финансовых средств и системы оценки эффективности поставленных задач.